Im Rahmen der Kooperation von kirchlicher Jugendarbeit und Schule werden am Hölderlin-Gymnasium Schülerinnen und Schüler am Ende der Klassenstufe 8 und in Klasse 9 in mehreren Ausbildungsmodulen zu Schülermentorinnen und -mentoren ausgebildet. Grundlage ist das Junior-Schülermentorenprogramm (jSMP) der Kirchen. Die Ausbildung wird von einem Jugendreferenten des Evangelischen Jugendwerks Nürtingen in Zusammenarbeit mit dem Team der Schulsozialarbeit des Hölderlin-Gymnasiums durchgeführt. Den TeilnehmerInnen werden Kompetenzen vermittelt, Gruppen zu leiten und das Schulleben mitzugestalten. Die Schülerinnen und Schüler lernen Verantwortung zu übernehmen, sie erwerben Schlüsselqualifikationen wie Kooperationsfähigkeit, Kommunikationsfähigkeit, Konfliktfähigkeit und Empathie und sie werden zu ehrenamtlichem Engagement befähigt. Ab Klasse 9 haben die SuS dann die Möglichkeit, sich im Rahmen der Ganztagesbetreuung am HöGy als Paten für die 5. Klassen zu engagieren, in der Spieleausleihe mitzuarbeiten oder im Raum der Stille die “Stille Zeit” in der Mittagspause anzuleiten.

In Klasse 10 wird im Rahmen der “Tage der Orientierung” eine Fahrt zur ökumenischen Taizé-Bruderschaft in Frankreich angeboten. Sie findet in Kooperation mit dem Evangelischen Jugendwerk Nürtingen statt.

In einer Kooperation von Religionsunterricht und Jugendarbeit der katholischen Kirche (Jugendreferentin und Team der KSJ) wird in einzelnen Religionsgruppen ein Orientierungstag zu Themen des Erwachsenwerdens angeboten.

Im Jahr 2009 wurde im Rahmen des Neubaus der Raum der Stille für unsere Ganztagesschule eingerichtet, an dessen Innengestaltung sich auch die evangelische und katholische Kirche beteiligten. Er wird in der Mittagspause genutzt für offene Angebote für alle Schülerinnen und Schüler, wie die „Stille Zeit“ oder die Meditations-AG zur Entschleunigung und zum Durchatmen während eines langen Schultages.